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TALLER VIRTUAL - Introducción a la pangenómica con Roary para jóvenes microbiólogos.-

FINALIZADO

TALLER

TALLER VIRTUAL - Introducción a la pangenómica con Roary para jóvenes microbiólogos.-
INSCRIPCIÓN CERRADA

FECHA DE REALIZACIÓN: 27 y 29 de Noviembre, y 1 de Diciembre 2023.-

 

 

HORARIO: 9 a 13.30 hs.-

 

 

COMITÉ ORGANIZADOR:  

- Presidente: Dr. Mariano Elean
- Vicepresidente: Dr. Leonardo Albarracin
- Secretaria de Actas: Dra. Stefania Dentice Maidana
- Secretario científico: Lic. Rodrigo Exequiel Serda
- Tesorera: Dra. Lorena Paola Arce

 

 

DOCENTES:

- Dr. Mariano Daniel Elean

- Dr. Leonardo Albarracin.

 

INTRODUCCIÓN: 

Con el avance de la tecnológica en el campo de la genómica los costos de secuenciación han disminuido drásticamente en los últimos años. Secuenciar un genoma bacteriano hoy por hoy es algo relativamente accesible para cualquier laboratorio. Como resultado, el número de genomas disponibles en bases de datos se ha incrementado en mas de 100 veces en los últimos 10 años. Para estudiar y obtener conclusiones validas a partir de genomas, surgió la genómica comparativa. La genómica comparativa es la rama de la genética que estudia las diferencias y similitudes entre el genoma de diferentes especies, más o menos cercanas evolutivamente. Esta disciplina, además, se encarga del estudio de las diferencias genómicas entre individuos de la misma especie.

El creciente número de genomas disponibles y la información contenida en cada uno de ellos, plantea un desafío para su análisis. Para dar respuesta a esta necesidad, surgieron diversas herramientas bioinformáticas. Considerando la importancia de la genómica comparativa como complemento a los ensayos microbiológicos de laboratorio, se propone este taller para introducir a los jóvenes microbiólogos en algunas de las herramientas bioinformáticas disponibles.

 

OBJETIVOS:

1) Introducir a los jóvenes microbiólogos en la búsqueda y análisis de genomas en las diversas bases de datos disponible;
2) Abarcar la utilización del algoritmo blast y sus derivados;
3) Explorar las herramientas y utilidades del servidor Rast para la visualización de genomas;
4) Formar en la utilización de prokka para re-anotar genomas;
5) Introducir en la utilización de Roary como herramienta de análisis pangenómico.

 

 

CONDICIONES QUE DEBEN REUNIR LOS INSCRIPTOS: Alumnos o profesionales en Bioquímica, Biotecnología, Microbiología, Informática o relacionadas.

 

 

MODALIDAD DE CURSADA: 

- Los talleres se llevarán a cabo de forma virtual a través de plataforma ZOOM. Además, los videos se encontrarán disponibles para verlos de manera asincrónica.

- Se requiere que los alumnos tengan una cuenta en el servidor Rast antes de iniciar el curso. La misma puede ser creada gratuitamente en la página: https://rast.nmpdr.org 

- No hace falta disponer de una computadora con Linux instalado ya que se enviará una maquina virtual en la que podrán llevar a cabo los ejercicios.

 

 

ARANCELES:

 

SOCIOS AAM * $ 4000.-
PROFESIONALES NO SOCIOS (ARGENTINA) $ 8000.-
ESTUDIANTES SOCIOS AAM ** $ 2000.-
ESTUDIANTES NO SOCIOS *** (ARGENTINA) $ 4000.-
NO SOCIOS - MIEMBROS DE ENTIDADES CON CONVENIO **** $ 4000.-
EXTRANJEROS y NO RESIDENTES EN ARGENTINA u$s 50.-

 

Socios AAM: éste beneficio se otorgará solamente a los asociados que tengan al día sus cuotas societarias y 1 año de antigüedad como mínimo; ó a los que se asocien abonando un año por adelantado.

** Estudiante socio: asociados a la AAM en categoría de “Estudiante”; estudiantes de postgrado afiliados en categoría "Adherente" ó "Titular" con menos de 5 años de obtenido el título de grado.

*** Estudiante no socio: Estudiante de grado en curso; ó de Maestría, Doctorado ó Residentes, que presenten un certificado actualizado acreditando su condición y que cuenten con menos de 5 años de obtenido el título de grado.

**** No Socios con Convenio: encuentre aquí el listado de entidades (http://www.aam.org.ar/convenio.php); recuerde que deberá presentar un certificado de la misma que acredite su pertenencia.

 

 

FORMAS DE PAGO:

- DÉBITO AUTOMÁTICO - medio exclusivo para socios que se encuentren adheridos a dicho sistema y abonen sus cuotas de ésa manera; solamente deberá seleccionar ésta opción y nosotros realizaremos el débito correspondiente.

- PAYU - plataforma online de pago seguro que le permitirá abonar el arancel con diferentes tarjetas de crédito, débito, Rapipago ó Pagofacil. Deberá marcar ésta opción y seguir las instrucciones del sitio al que se le redirigirá para emitir el cupón de pago correspondiente.

 

 

-.ATENCIÓN: LA INSCRIPCIÓN SE ENCUENTRA CERRADA DESDE EL 19 de NOVIEMBRE, sin excepción.-

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